ANÁLISE IN SILICO DO GENE LIPID TRANSFER PROTEIN SOB CONDIÇÕES DE ESTRESSE ABIÓTICO
As respostas de plantas ao estresse
abiótico são muitas vezes complexas, por isso,
nos últimos anos, muito se tem feito para isolar
genes induzidos durante o déficit hídrico, a fim
de estudar a função de produtos gênicos e os
caminhos que conduzem à indução. Analisar
in silico a expressão de genes pode contribuir
de forma expressiva para elucidar as rotas de
defesa das plantas, contribuindo sobremaneira
para o melhoramento da cultura. O estudo
teve como objetivo compreender in silico a
relação da proteína LTP e a tolerância ao
estresse por seca. A sequência do gene LTP foi
adquirida no BCCCenter e o sequenciamento
foi realizado para confirmação e caracterização
da molécula de interesse. A análise in silico foi
realizada mediante utilização dos softwares
de bioinformática. O sequenciamento resultou
em mais de 1200 bp, com o frame 1 (+)
apresentando o domínio da proteína, que
contempla proteínas de transferência lipídica.
É classificada no clã protéico da prolamina. A
estrutura secundária da proteína compreende
em grande parte folhas beta (79), seguido por
hélices alfa (50). De acordo com o “software
Aramemnon” a indução do gene LTP em
Arabidopsis na condição de estresse osmótico
acontece por toda a planta, incluindo sistema
radicular, hipocótilo e folhas, com indução
máxima para os tempos analisados em 12 e 24
horas. A proteína LTP em condições de estresse
por seca, possivelmente está envolvida com a
transferência de lipídios para a contribuição da
tolerância das plantas ao estresse
ANÁLISE IN SILICO DO GENE LIPID TRANSFER PROTEIN SOB CONDIÇÕES DE ESTRESSE ABIÓTICO
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DOI: 10.22533/at.ed.3771916012
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Palavras-chave: estresse abiótico, in silico, gene.
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Keywords: abiotic stress, in silico, gene.
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Abstract:
Plant responses to abiotic stress
are often complex, so in recent years much has
been done to isolate genes induced during water
deficit in order to study the function of gene
products and the pathways leading to induction.
Analyzing in silico the expression of genes can
contribute in an expressive way to elucidate
the routes of defense of the plants, contributing
greatly to the improvement of the culture. The
objective of this study was to understand in silico
the relationship of LTP protein (Lipid Transfer Protein) and the tolerance to drought stress. The LTP gene sequence was purchased
from BCCCenter and sequencing was performed for confirmation and characterization
of the molecule of interest. The in silico analysis was performed using the bioinformatics
software BlastX, Bioedit, Pfam 30.0, SMART, CFSSP, Aramemnon 8.1. Sequencing
resulted in more than 1200 bp, with frame 1 (+) showing the protein domain, which
contemplates lipid transfer proteins. It is classified in the prolamin protein clan. The
secondary structure of the protein largely comprises beta sheets (79), followed by alpha
helices (50). According to the “Aramemnon software” the induction of the LTP gene in
Arabidopsis in the osmotic stress condition occurs throughout the plant, including root
system, hypocotyl and leaves, with maximum induction for the analyzed times in 12
and 24 hours. The LTP protein under drought stress conditions is possibly involved with
lipid transfer to the contribution of plant tolerance to stress.
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Número de páginas: 15
- Renan Gonçalves da Silva
