APLICAÇÃO DE MODELAGEM ESTRUTURAL DE POLIMORFISMOS DE BASE ÚNICA EM GENES ALVO RELACIONADOS À RESPOSTA A RADIOTERAPIA EM PACIENTES COM CÂNCER DE MAMA
Objetivo: Acessar, através de plataformas de modelagem molecular, quais as alterações causadas à estrutura das proteínas pelos SNP’s selecionados, e relaciona-las aos efeitos colaterais de radiação. Comparar as análises de modelagem com os resultados dos ensaios de microarranjos para câncer de mama. Método: Com base na sua relevância com relação ao câncer mama e análise prévia foram selecionados os genes CHEK2, BRCA2 e XRCC1, sendo o critério de escolha o resultado das predições de possíveis impactos das trocas sugestivas de mutações danosa às funções metabólicas desempenhas pela proteína mutante, através da ferramenta de predição de impacto funcional estrutural, PolyPhen. Adicionalmente, foram selecionados os ensaios de microarranjos de 78 pacientes do serviço de Radioterapia do Hospital Araújo Jorge, utilizando o painel Axiom® Exome (Affymetrix®, Inc, USA). As reações adversas à radioterapia foram classificadas segundo o Radiation Therapy Oncology Group (RTOG) e selecionados os genes de cada SNP de interessenos bancos de dados de cada paciente. Resultados: Para os genes, CHEK2, BRCA2 e XRCC1, os polimorfismos selecionados foram Ile200Thr (rs17879961), Ile2944Phe (rs4987047) e Arg399Gln (rs25487), respectivamente. Em uma análise univariada, não houve associação significante do polimorfismo de CHEK2 com a toxicidade cutânea aguda de alto grau (OR=0,667, 95% CI 0,129- 3,442, p=919), nem lesão cutânea tardia (OR=0,806, 95% CI 0,090-7,229, p=0,740). Também não houve significância estatística para BRCA2 (OR=8,250, 95% CI 0,469-145,118, p=0,550) em lesão cutânea tardia, bem como para XRCC1 – lesão aguda (OR=1,435, 95% CI 0,515-4,001, p=0,668), ou tardia (OR=1,741, 95% CI 0,429-7,072, p=0,672). Conclusão: As plataformas de modelagem molecular são extremamente úteis na análise de mutações, e podem contribuir com novos estudos de associações entre perfis genéticos de pacientes submetidos à radioterapia. A ausência de correlação estatística significante entre as mutações e os efeitos colaterais em pele e subcutâneo encontradas nos ensaios de microarranjos, não descarta a necessidade de maior aprofundamento das pesquisas em radioterapia individualizada para pacientes com câncer de mama.
APLICAÇÃO DE MODELAGEM ESTRUTURAL DE POLIMORFISMOS DE BASE ÚNICA EM GENES ALVO RELACIONADOS À RESPOSTA A RADIOTERAPIA EM PACIENTES COM CÂNCER DE MAMA
-
DOI: 10.22533/at.ed.6742027052
-
Palavras-chave: Câncer de Mama, Radioterapia, Radiossensitividade, Efeitos Adversos
-
Keywords: Breast cancer, adverse effects, radiotherapy, radiosensitivity
-
Abstract:
Objective: Access through molecular modeling platforms, which changes are made to the structure of proteins by the selected SNPs, and relate them to the side effects of radiation. Compare the modeling analyzes with the results of the microarray assays for breast cancer. Method: Based on their relevance in relation to breast cancer and previous analysis, the CHEK2, BRCA2 and XRCC1 genes were selected, the choice criterion being the result of the predictions of possible impacts of changes suggestive of harmful mutations to the metabolic functions performed by the mutant protein, through the functional and structural impact prediction tool, PolyPhen. Additionally, the microarray assays of 78 patients from the Radiotherapy service of Hospital Araújo Jorge were selected, using the Axiom® Exome panel (Affymetrix®, Inc, USA). Adverse reactions to radiotherapy were classified according to the Radiation Therapy Oncology Group (RTOG) and the genes of each SNP of interest were selected from each patient's database. Results: For the genes, CHEK2, BRCA2 and XRCC1, the polymorphisms selected were Ile200Thr (rs17879961), Ile2944Phe (rs4987047) and Arg399Gln (rs25487), respectively. In an univariate analysis, there was no significant association of the CHEK2 polymorphism with high-grade acute skin toxicity (OR = 0.667, 95% CI 0.129-3.442, p = 919), or late skin lesion (OR = 0.806, 95% CI 0.090 -7.229, p = 0.740). There was also no statistical significance for BRCA2 (OR = 8.250, 95% CI 0.449-145.118, p = 0.550) in late skin lesion, as well as for XRCC1 - acute injury (OR = 1.435, 95% CI 0.515-4.001, p = 0.668 ), or late (OR = 1.741, 95% CI 0.429-7.072, p = 0.672). Conclusion: Molecular modeling platforms are extremely useful in the analysis of mutations, and can contribute to new studies of associations between genetic profiles of patients undergoing radiotherapy. The absence of a significant statistical correlation between the mutations and the side effects on skin and subcutaneous tissue found in microarray trials does not rule out the need for further research on individualized radiotherapy for patients with breast cancer.
-
Número de páginas: 23
- Pollyana Rodrigues Pimenta
- Yuri de Abreu Mendonça
- Renata Bastos de Ascenço Soares
- Satyaki Afonso Navinchandra
